旗帜的划分是以过去鄂托克族和埃马克族的封建领地为基础，尽可能的划分，即每一部分划分为几面旗帜，只有几个部门把原来的部分编为一面旗帜。这一措施便于清政府统一管理。
旗内基本管理都是金字塔型的。金字塔顶端是扎萨克旗，负责旗内的一般行政和军事事务。皇太极和关琦张静副使齐泽萨克处理旗务。
官方名称扎萨克在蒙古语中是“领事”的意思，是一种
清朝主要授予蒙古人和满族人军事和政治头衔
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今天，作为内蒙古的一个行政单位，旗相当于其他省、自治区的县。现在内蒙古有52面旗(包括3面自治旗)，主要是少数民族聚居的地方。
采木
其最基层的组织是鲁牛，管理与苏牧有关的一切事务，其副手是昆都。苏牧蒙古语原意为“箭”。清政府对旗的管理办法是:旗内苏木数超过十个的，有两个张静，不足十个的，有一个张静，管理一般地方旗务，由太极副经理和旗长张静控制。苏沐手下的组织是十户之主达禄格，战时指挥士兵，平时维护治安，查办户口。
苏牧蒙古语原意是“箭”，蒙古人真的很重视射箭
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内蒙古自治区成立于年，沿袭了传统的苏木建制，成为蒙古族乡级行政建制的俗称，是中国内蒙古自治区特有的一个乡级行政区。
目前，苏木主要分布在内蒙古自治区的畜牧区。随着经济和社会的发展，近年来，就像农业地区的乡镇合并一样，也出现了苏木合并，或者是撤苏木设镇等行政区划的调整。2014年内蒙古自治区苏木106株。除呼和浩特、乌海外，苏木分布在其他10个城市。
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需要注意的是，内蒙古的很多地名虽然以“好特”结尾，但好特的命名或划分依据与上面的孟、齐、苏沐不同，不属于行政单位的划分范畴。豪特最初是指蒙古族牧民居住的自然村落，后来也指城市。有句话说，蒙古人把两个挨着的蒙古包叫做旅馆。
数数有多少只绿巨人。
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现在的“好特”大多保留了“城”的意思进行统称。比如呼和浩特，原名贵穗，因为呼和浩特的中心城市是清末民国时期归化和绥远合并形成的。贵穗于1954年更名为呼和浩特，蒙古语意为“蓝城”。
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再比如锡林浩特。锡林浩特市位于内蒙古自治区中部，就在锡林郭勒盟所在地北京的北面。锡林浩特的意思是山脚下的城市，有人称之为“紫色城市”。同样，“郭乐”在蒙古语中的意思是“河”，有时也翻译成“高乐”。也不属于行政单位范畴。
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由联盟和旗帜命名的昨天和今天
团名和旗名之所以能用，主要是因为它们与现行体制的两级(地级市县)基本重合。在一定的历史时期内，两种命名方式在地域管理上并不冲突。因此，联合和旗帜作为地区划分的习惯用法被保留(部分)。