随后，巴萨迎来了瓜迪奥拉时代，伊涅斯塔成为球队的基石之一。巴萨称霸足坛四五年，常被称为历史上最好的球队。从那以后，小白正式承担了更多的责任。他和哈维一起把巴萨的传球和踢球发挥到了极致，把球队的成功带到了空之前。
渐渐地，球迷们把伊涅斯塔当成了巴萨的标志之一。伊涅斯塔在巴萨发挥了如此重要的作用，以至于在2009年欧冠决赛前，弗格森挑出小白进行有针对性的战术安排。但这并没有阻止宇宙队登顶。
赛后，鲁尼在更衣室里惊讶地说，我们被一支由最优秀球员带领的强大球队打败了。当然，鲁尼的“最佳球员”不是梅西或者哈维，而是伊涅斯塔。
(伊涅斯塔在游戏里)
团队领导的更换
伊涅斯塔无疑是2014/15赛季初下一任队长的第一候选人。那一年，巴萨成为历史上第一支两次成为“五冠”的球队。哈维不在时，队长袖标由小白佩戴。不久之后，小白正式接替哈维担任队长。正是从那个时候起，巴萨开始痛苦的转型，这种痛苦一直延续到现在。
罗马逆转欧冠，预示着巴萨不再是令人畏惧的宇宙球队。但在17/18赛季，伊涅斯塔带领球队以队长身份夺得国内双冠，并在金杯决赛中攻入一球。即使在诺坎普的告别赛中，小白也没有被离别的悲伤所影响，仍然展示了他最好的表现。但也让当时的粉丝有点担心。没有伊涅斯塔的球队会怎么样？
离别总会到来。伊涅斯塔这个在球场上控制时间和空的人，终于离开了自己心爱的红蓝军团。当他说再见时，梅西给了小白一个大大的拥抱，他久久不愿放手，因为新队长知道他再也不能像以前那样得到小白的鼓励了。
(哈维和伊涅斯塔)
专职团队领导
伊涅斯塔不是典型的球队队长，这是他和普通球员的另一个区别。他不会像卡恩那样大喊大叫，对队友发号施令；他没有前队长普约尔那么强硬。像梅西一样，小白喜欢以身作则，用他在球场上的表现说话。当然，这不是他帮助球队的唯一方式。
瓜迪奥拉担任巴萨主帅时，球队开局不顺，瓜帅面临被罚危机。那时候的巴萨没有冠军气质，更不用说害怕了。一天，敲门声把瓜帅从战术笔记中惊醒。他打开门一看，原来是小伊涅斯塔。小白对瓜帅说:“你好，教练。别担心，教练，我们会赢得所有冠军的。我们走在正确的道路上，坚持下去，好吗？我们踢得很好，喜欢训练。请保持下去。”
伊涅斯塔当时并不是球队的大老板，在球队里没有发言权，但他还是鼓足勇气说出了自己的想法。这也证明了伊涅斯塔虽然不喜欢发表意见，但是在球队需要的时候，他会挺身而出。在克鲁伊夫的公开支持和伊涅斯塔的私下鼓励下，瓜迪奥拉坚持并带领球队创造了第六冠的奇迹。瓜帅曾经说过:“每个人都认为球队中的教练是负责鼓舞士气和说服球员的。但有时候恰恰相反。伊涅斯塔告诉我有困难时不要担心。这相当令人惊讶，因为他通常看起来不善言辞。”
